Pour avoir la liste complète des options disponibles de MEncoder et des exemples, voir la page de man. Pour une série d'exemples pratiques et de guides détaillés sur l'utilisation des nombreux paramètres d'encodage, lisez les encoding-tips (en anglais) qui ont été collectés sur de nombreuses threads de la liste de diffusion mplayer-users. Cherchez dans les archives pour trouver les discussions à propos de tous les aspects et problèmes relatifs à l'encodage avec MEncoder.